Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDHBP07195 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDHBP07195 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDHBP07195 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDHBP07195 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHBP07195 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHBP07195 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHBP07195 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHBP07195 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHBP07195 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHBP07195 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHBP07195 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHBP07195 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHBP07195 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHBP07195 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LDHBP07195 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LDHBP07195 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LDHBP07195 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LDHBP07195 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHBP07195 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDHBP07195 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDHBP07195 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDHBP07195 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDHBP07195 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDHBP07195 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDHBP07195 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDHBP07195 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDHBP07195 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDHBP07195 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDHBP07195 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LDHBP07195 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms