Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV3-7P01780 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms