Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLIN3O60664 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms