Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms