Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM200CA6NKL6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms