Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A6NIN4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A6NIN4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A6NIN4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NIN4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A6NIN4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A6NIN4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A6NIN4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A6NIN4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A6NIN4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A6NIN4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms