Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms