Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms