Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms