Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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