Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms