Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms