Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC4Q9UBN4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms