Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PDP1Q9P0J1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDP1Q9P0J1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms