Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TVP23BQ9NYZ1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TVP23BQ9NYZ1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms