Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7BPQ9NSQ0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms