Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEC31BQ9NQW1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms