Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZYG11BQ9C0D3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms