Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWU1

CDK19, Cyclin-dependent kinase 19, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK19Q9BWU1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK19Q9BWU1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms