Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGS1Q96RS0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms