Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms