Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms