Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR2Q969E8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR2Q969E8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms