Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms