Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HELQQ8TDG4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HELQQ8TDG4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HELQQ8TDG4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HELQQ8TDG4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HELQQ8TDG4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HELQQ8TDG4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HELQQ8TDG4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HELQQ8TDG4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HELQQ8TDG4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms