Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCOLN3Q8TDD5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms