Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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