Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms