Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC50Q8IVM0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC50Q8IVM0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms