Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms