Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD7BQ6GQQ9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD7BQ6GQQ9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms