Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms