Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q499Y3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q499Y3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q499Y3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q499Y3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q499Y3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q499Y3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q499Y3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q499Y3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q499Y3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q499Y3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q499Y3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q499Y3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q499Y3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q499Y3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q499Y3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q499Y3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q499Y3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q499Y3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q499Y3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms