Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK5Q16478 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
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