Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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