Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZFHX3Q15911 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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