Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPTX1Q15818 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms