Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.174e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.214e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.214e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.214e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-215ENST00000497139 2746 ntTSL 1 (best)12.46□□□□□ -0.424e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-212ENST00000480614 12167 ntTSL 1 (best)9.74□□□□□ -0.854e-7■■□□□ 11.7
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PCBP1Q15365 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.781e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 ASPSCR1-216ENST00000583503 641 ntTSL 319.85■□□□□ 0.772e-6■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.733e-6■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 COL18A1-201ENST00000342220 3386 ntTSL 213.51□□□□□ -0.253e-7■■□□□ 11.7
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PCBP1Q15365 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.363e-11■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 PRMT1-220ENST00000534676 915 ntTSL 221.22■□□□□ 0.993e-11■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.953e-11■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 PRMT1-218ENST00000534280 766 ntTSL 320.6■□□□□ 0.893e-11■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.543e-11■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 PRMT1-203ENST00000524771 713 ntTSL 318.03■□□□□ 0.483e-11■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.323e-11■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 PRMT1-214ENST00000529836 580 ntTSL 316.48■□□□□ 0.233e-11■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 PRMT1-207ENST00000527382 699 ntTSL 314.28□□□□□ -0.123e-11■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 PRMT1-219ENST00000534465 779 ntTSL 314.28□□□□□ -0.123e-11■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 PRMT1-211ENST00000528623 543 ntTSL 314.09□□□□□ -0.153e-11■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 PRMT1-212ENST00000529284 1182 ntTSL 512.71□□□□□ -0.373e-11■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 PRMT1-206ENST00000526224 578 ntTSL 311.25□□□□□ -0.613e-11■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 PRMT1-208ENST00000527412 463 ntTSL 38.83□□□□□ -13e-11■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.391e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.261e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 SPN-205ENST00000563039 1853 ntTSL 521.01■□□□□ 0.951e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 ACSS2-210ENST00000476922 1527 ntTSL 220.5■□□□□ 0.872e-11■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 ACSS2-211ENST00000477932 2450 ntTSL 520.33■□□□□ 0.852e-11■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 SPN-203ENST00000436527 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)20.15■□□□□ 0.821e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.761e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 ZFAND5-207ENST00000487330 631 ntTSL 219.45■□□□□ 0.71e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 SLC29A2-204ENST00000541567 2272 ntTSL 1 (best)18.89■□□□□ 0.611e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 TKT-204ENST00000450814 1941 ntTSL 218.83■□□□□ 0.61e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.562e-11■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 TKT-213ENST00000487660 610 ntTSL 218.4■□□□□ 0.541e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.511e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.391e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.391e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.311e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 TKT-211ENST00000472528 1055 ntTSL 1 (best)16.83■□□□□ 0.281e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 SLC29A2-203ENST00000540386 2474 ntTSL 1 (best)16.61■□□□□ 0.251e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.251e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.121e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.122e-11■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 PRKAB1-203ENST00000537400 555 ntTSL 315.58■□□□□ 0.081e-7■■□□□ 11.6
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PCBP1Q15365 TKT-210ENST00000469678 1871 ntTSL 515.28■□□□□ 0.041e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.161e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.241e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.331e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 TKT-208ENST00000462138 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.431e-7■■□□□ 11.6
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PCBP1Q15365 ACSS2-214ENST00000481284 2851 ntTSL 210.28□□□□□ -0.762e-11■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 RPS6-204ENST00000380394 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.851e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 SAMD5-202ENST00000566741 393 ntTSL 36.21□□□□□ -1.421e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.661e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.741e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 AL033504.1-203ENST00000442094 404 ntTSL 33.56□□□□□ -1.841e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 AL033504.1-202ENST00000432506 406 ntTSL 23.38□□□□□ -1.871e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.232e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 CPE-205ENST00000513982 564 ntTSL 48.89□□□□□ -0.992e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 TNRC18-206ENST00000434361 577 ntTSL 317.88■□□□□ 0.456e-10■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 GATA2-206ENST00000498200 563 ntTSL 220.65■□□□□ 0.92e-6■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 ENO1-202ENST00000464920 2266 ntTSL 1 (best)14.01□□□□□ -0.176e-13■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.296e-13■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 PGGHG-207ENST00000482937 734 ntTSL 518.44■□□□□ 0.547e-10■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.671e-19■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.161e-19■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-202ENST00000444874 2661 ntTSL 214.65□□□□□ -0.062e-6■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-204ENST00000472646 553 ntTSL 512.34□□□□□ -0.432e-6■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-201ENST00000310771 3634 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.712e-6■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.141e-12■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.161e-12■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.361e-12■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.343e-6■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 PRPF38B-204ENST00000467302 2043 ntTSL 1 (best)15.27■□□□□ 0.043e-6■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 PRPF38B-203ENST00000370025 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.723e-6■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 PRPF38B-201ENST00000370021 3728 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.823e-6■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 DDIT4-203ENST00000473155 753 ntTSL 1 (best)23.02■■□□□ 1.283e-7■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.741e-67■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.71e-67■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 TTYH3-207ENST00000498454 587 ntTSL 223.27■■□□□ 1.329e-8■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 POR-202ENST00000412064 1044 ntTSL 515.07■□□□□ 05e-17■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.051e-11■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.11e-11■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.181e-11■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.231e-11■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.271e-11■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 PRAME-213ENST00000492657 2831 ntTSL 1 (best)13.26□□□□□ -0.291e-11■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 SNRNP200-202ENST00000429650 2637 ntTSL 213.61□□□□□ -0.233e-6■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 SNRNP200-208ENST00000497539 2666 ntTSL 1 (best)12.24□□□□□ -0.453e-6■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 SNRNP200-201ENST00000323853 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.643e-6■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 SNRNP200-203ENST00000480242 3409 ntTSL 28.56□□□□□ -1.043e-6■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 FAM234B-202ENST00000416494 2623 ntTSL 212.21□□□□□ -0.456e-27■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 FAM234B-201ENST00000197268 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.586e-27■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 CIZ1-220ENST00000485862 843 ntTSL 217.95■□□□□ 0.463e-6■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 CIZ1-210ENST00000461765 677 ntTSL 39.18□□□□□ -0.943e-6■■□□□ 11.5
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