Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NCF4Q15080 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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