Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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