Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CKAP5Q14008 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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