Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DDX39BQ13838 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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