Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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CDH18Q13634 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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CDH18Q13634 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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CDH18Q13634 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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