Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms