Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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