Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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