Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
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