Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms