Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC9Q06265 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms