Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms